La sala de exposiciones temporales es un espacio ubicado en la primera planta del museo donde se organizan muestras temporales relacionadas con la arqueología, la paleontología y el patrimonio, tanto regional como nacional. Su superficie diáfana de 188 m2 puede articularse con muros modulares y cuenta con el equipamiento técnico y los recursos expositivos necesarios para exhibir y desarrollar los discursos de cada exposición.